潔凈室技術(shù)經(jīng)歷半個(gè)世紀(jì)的發(fā)展，其應(yīng)用范圍越來(lái)越廣泛，技術(shù)要求也越來(lái)越復(fù)雜。目前，它的代表性應(yīng)用領(lǐng)域?yàn)槲㈦娮庸I(yè)、醫(yī)藥衛(wèi)生及食品工業(yè)等。它的應(yīng)用領(lǐng)域主要有：
1、微電子工業(yè)。
2、半導(dǎo)體制造業(yè)。
3、微機(jī)械加固業(yè)。
4、光學(xué)工業(yè)。
5、純化學(xué)試劑制造業(yè)。
6、生物技術(shù)工業(yè)。
7、制藥工業(yè)。
8、醫(yī)療器械與移植裝置的生產(chǎn)與包裝工業(yè)。
9、食品與飲料工業(yè)。
10、醫(yī)院及其他保健機(jī)構(gòu)。
一.微電子工業(yè)：
微電子工業(yè)是當(dāng)前對(duì)潔凈室要求最高的行業(yè)。大規(guī)模和超大規(guī)模集成電路（LSI、VLSI）的發(fā)展，對(duì)微塵控制要求越來(lái)越高。集成電路制造工藝中，集成度越大，圖形尺寸（以線寬為代表）越細(xì)，對(duì)潔凈室控制粒徑的尺寸也要求越?。ㄍǔ榫€寬的1/10），且含塵量也要求越低。此外，現(xiàn)代工業(yè)中的液晶、光纖等的生產(chǎn)，同樣有潔凈度的要求。
二.醫(yī)療工業(yè)：
（1）藥品生產(chǎn)我國(guó)的《藥品生產(chǎn)管理規(guī)范》（又稱(chēng)GMP）已在全國(guó)范圍內(nèi)實(shí)施，對(duì)相應(yīng)工藝過(guò)程及生產(chǎn)環(huán)境提出了不同潔凈級(jí)別的要求。對(duì)于原料藥制備、粉劑、針劑、片劑、大輸液的生產(chǎn)、灌裝等工藝，均已制定了潔凈區(qū)和控制區(qū)的潔凈標(biāo)準(zhǔn)。除了限定空氣中塵埃粒子的大小和含量外，對(duì)生物粒子（細(xì)菌數(shù)）也有明確的限制。
（2）醫(yī)院白血病的治療室、燒傷病房、外科手術(shù)室，也必須根據(jù)具體條件采用空氣潔凈技術(shù)，以防止空氣中細(xì)菌感染，對(duì)治療環(huán)境起到控制作用。
三.食品工業(yè)：食品工業(yè)中使用潔凈技術(shù)較有代表性的是無(wú)菌裝罐。食品的無(wú)菌包裝（如軟包裝鮮果汁、牛乳等），在保持食品色、香、味、營(yíng)養(yǎng)等方面大大優(yōu)于高溫殺菌的罐裝食品。所謂無(wú)菌包裝，就是在潔凈環(huán)境中完成包裝工藝。除無(wú)菌罐裝外，空氣潔凈技術(shù)在食品的釀造、發(fā)中對(duì)純種的培養(yǎng)、分離、接種、擴(kuò)種以防止菌體等污染及提高產(chǎn)品質(zhì)量也有重要作用。
四.生物安全：在遺傳工程、藥品及病理檢驗(yàn)、生物分子學(xué)、國(guó)防科研等方面常常需要在無(wú)菌無(wú)塵的環(huán)境中進(jìn)行操作方面要求試件不受其他微生物污染，另一方面又要求所研究的材料，如腫瘤病毒、高危險(xiǎn)度病原菌、放射性物質(zhì)等不致外溢，危害操作者的健康及污染環(huán)境。對(duì)于這類(lèi)實(shí)驗(yàn)操作，一般要求兩級(jí)隔離，第一級(jí)常用生物安全工作柜使工作人員與病原體等危險(xiǎn)試件隔離；第二級(jí)是將實(shí)驗(yàn)工作區(qū)與其他環(huán)境隔離。這類(lèi)實(shí)驗(yàn)室與一般潔凈室不同，其處于負(fù)壓狀態(tài)。
五.實(shí)驗(yàn)動(dòng)物飼養(yǎng)：為了保證醫(yī)藥品、食品長(zhǎng)期試驗(yàn)的安全性，以及病理等方面研究結(jié)果的可靠性，要求實(shí)驗(yàn)動(dòng)物在潔凈環(huán)境中飼育。從控制微生物的角度出發(fā)，可將醫(yī)學(xué)及生物學(xué)等實(shí)驗(yàn)所用的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物飼育環(huán)境分為三類(lèi)：隔離系統(tǒng)、半隔離系統(tǒng)和開(kāi)放系統(tǒng)。前兩類(lèi)系統(tǒng)所飼養(yǎng)動(dòng)物要求無(wú)菌（包括細(xì)菌、病毒寄生蟲(chóng)等），或者僅允許帶有已知的幾種微生物，或者不允許帶有某些特定的致病菌等。
空氣潔凈技術(shù)也廣泛應(yīng)用于字航、精密機(jī)械、儀器儀表、精細(xì)化學(xué)等行業(yè)中。
