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    1、控制對象
    工業(yè)潔凈室以無生命微粒（包括無機(jī)微粒和有機(jī)微粒）為控制對象。
    生物潔凈室以有生命微粒(單細(xì)胞藻類、菌類、原生動物、細(xì)菌和病毒等)為控制對象。
    2、應(yīng)用行業(yè)
    工業(yè)凈化車間主要應(yīng)用于電子工業(yè)(集成電路、精密電子、光電行業(yè)等)、印刷工業(yè)、精密工業(yè)、原子能工業(yè)等。
    生物潔凈車間主要應(yīng)用于無菌手術(shù)室、病房、制藥潔凈車間、化妝品生產(chǎn)凈化車間、食品行業(yè)生產(chǎn)車間、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室等及要求控制室內(nèi)細(xì)菌含量的無菌潔凈場合。
    3、壓差控制
    生物潔凈車間又分為一般生物潔凈室和生物安全潔凈室(如青霉素生產(chǎn)車間、艾滋病防治的研究實(shí)驗(yàn)室等)，一般生物潔凈室的壓差為正壓，生物安全潔凈室為負(fù)壓。
    關(guān)于一般生物潔凈車間和生物安全潔凈車間的區(qū)別可參照：http://www.innovaycf.com/news-shows-czo1OiIzNjh8MSI7.html
    工業(yè)潔凈車間壓差一般為正壓。
    4、清潔方式

    生物潔凈車間和工業(yè)潔凈車間都要應(yīng)用清除空氣中微粒的原理，因此在本質(zhì)上它們是一樣的，所不同的是控制參數(shù)中增加了控制室內(nèi)細(xì)菌的濃度。在一般情況下，潔凈度、細(xì)菌的濃度較之溫度、濕度的控制更為重要。而細(xì)菌本身是有大小的，且細(xì)菌多以塵粒為寄存體，因此采用空氣凈化措施，控制室內(nèi)的潔凈度就能控制室內(nèi)的含菌量，到達(dá)無菌的目的，當(dāng)然還要采取一些其他凈化措施。對于付于表面的微粒，工業(yè)潔凈室一般采用擦洗的方法就可大大減少表面上的微粒數(shù)量，而生物潔凈室是針對有生命的微粒，一般擦洗可能給微粒帶來生命和營養(yǎng)，反而促進(jìn)其繁殖，增加微粒菌類的數(shù)量。因此，對于生物潔凈室來說，必須用表面消毒的辦法來取代一般的擦洗。